Словари лучше использовать в соответствии с их "специализацией". Например, в том, что касается правописания, рекомендации толкового словаря имеют меньшую силу, чем орфографического.
Кроме того, полезно почитать о принципах составления конкретного словаря. Так, словарь "Русское словесное ударение" М. В. Зарвы ставит целью дать единственный вариант ударения, и его рекомендации довольно строги (подробнее об этом написано здесь). Орфографический словарь РАН в этом смысле более демократичен: в нем указаны в том числе варианты, характерные для непринужденной речи (при этом дикторам радио и телевидения в работе эти варианты лучше не употреблять).
Поэтому, если вы настроены следовать самым строгим нормам ударения, ориентируйтесь на "Русское словесное ударение", но если в непринужденной речи вы используете другие варианты из орфографического словаря, это тоже не будет ошибкой.
Правильно: полощу, прополощи, прополоскай. Допустимо: полоскаю.
Правильно: средняя полоса.
К сожалению, такой фразеологизм нам неизвестен. В каком контексте он Вам встретился?
В данном контексте правильно: «размещено внутри полости устройства».
Верно: органы грудной и брюшной полости.
В этом случае кавычки уместны: принт "зебра". Слова в горох, в полоску, в клетку выделять кавычками не нужно.
В слове полочка от полка в значении «уменьшительное к пола́» корень -пол-, два суффикса и окончание: пол-оч-к-а.
В слове полочка от полка в значении «доска, горизонтально укрепленная на стене» корень полоч-, суффикс -к- и окончание -а.