Корректно: ...набор учащихся в 9-е классы или набор учащихся, окончивших 9-й класс.

Верно: тридцать две целых две десятых процента...

Верен первый вариант.

Такое написание возможно.

Для конструкций типа брат с сестрой допускается постановка сказуемого как в форме множественного, так и в форме единственного числа. Форма множественного числа сказуемого показывает, что действие, обозначаемое сказуемым, в равной мере приписывается всем действующим лицам. Форма единственного числа сказуемого показывает, что обозначаемое сказуемым действие приписывается первому из названных действующих лиц. Однако на наш взгляд в данном случае лучше выбрать форму множественного числа, так как действующих лиц много. В этом случае и обособление оборота вместе с двумя иноками Варлаамом Яцким и Мисаилом Повадиным не нужно. 

См. в «Википедии».

Верно: На девяносто девяти целых восьми десятых процента территории.

Правильно: две целых (части).

Правильно: одна тысяча сто двадцать две целых четыре десятых га.