Согласный ф в этом слове произносится мягко, произношение [фэн] неправильно. О некоторых закономерностях см. в ответе на вопрос № 287206.
Верно: тон, которым...
Верно слитное написание, однако предложение построено небезупречно, его лучше переформулировать.
Возможная форма им. п. мн. ч. - фоны.
Если название указывается с родовым словом (акционерное общество "Национальный негосударственный пенсионный фонд"), то ориентироваться следует на родовое слово общество, например: акционерное общество "Национальный негосударственный пенсионный фонд" заработало за 2015 год...
Да, здесь правильно слитное написание.