В указанном отрывке не нужны запятые и иные знаки препинания.
Слитное написание правильно.
Запятая не нужна. Оборот с предлогом согласно образует смысловой центр предложения.
В этом сложноподчиненном предложении запятая между частями не ставится, потому что перед подчинительным союзом когда стоит союз (частица) и. См. пункт а) параграфа 115 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
Предог вследствие того что носит книжный характер, а из-за того что стилистически нейтрален. По значению в этом предложении они не различаются.
Знаки препинания в этом предложении не требуются. Можно (но необязательно) поставить интонационное тире после а так.
Именительный падеж предпочтителен, он удобнее для читателя. Можно поправить: ...в ней различаются пять стадий...
Перестановки здесь нет: сочетание rv в латинском дало сочетание рв в русском.