Знаки препинания не нужны.
Правилен второй вариант.
Нет, такое название не склоняется: пчелы карника, пчелы породы карника.
Постановка этих знаков избыточна.
Верно: над Серпуховом.
Правильно: Царицыном.
Да, литературная норма требует склонять название города: г. Белосток – г. Белостока, г. Белостоку и т. д. Несклоняемый вариант можно встретить в официально-деловой речи, в канцелярских документах.
Наименование собаки корги может определяться как существительное мужского или женского рода в зависимости от пола конкретного представителя породы; ср.: моя корги, мой корги.
Прилагательное Чебаркульский здесь действительно начинается с прописной буквы, но не потому, что оно образовано от названия города, а потому, что это первое слово в названии организации.
Запятая поставлена верно.
