Запятая не нужна. Для ее постановки нет оснований.
Запятые нужны: Я проснулась, как обычно, в 9 часов утра.
Это не обращение.
Если имеется в виду название округа, то корректно с прописной и в кавычках: городской округ «Город Уфа».
А каков "смысл замысла"?
Следует писать с большой буквы: Уфа и Республика Башкортостан.
Верно: Доброе утро, Наташа! Добрый день, Наташа! Спокойной ночи, Наташа!
Сегодня редко встречаются приветственные формулы в виде пожеланий (Доброго Вам дня), но в XIX веке такие приветствия были распространены: "Доброго дня желаю любезному другу и благодетелю Ивану Ивановичу!" - отвечал городничий (Н. Гоголь); "Доброго вечера желаю вам, матушка" - сказал Ипатов, подходя к старухе и возвысив голос (И. Тургенев).
Грамматически все верно.
Правильно: в Уфе и (в канцелярской речи): в городе Уфе, в г. Уфе.
