Да, Вы написали правильно. Запятая «закрывает» определительный оборот.
Корректно со строчной оба слова.
Если патрулирование осуществляют стратегические комплексы (военная техника), то правильно патрулирование (чем?) стратегическими комплексами. Если стратегические комплексы (объекты) патрулируются, то – патрулирование (чего?) стратегических комплексов. Обратите внимание: предложение построено неудачно, нельзя сопоставлять маршрут с территорией.
Если стоит тире, то запятая не нужна.
Обособление не требуется.
Кавычки уместны.
Во втором предложении запятая не ставится. Придаточное предложение, состоящее из одного только союзного слова, не отделяется запятой.
При встрече вопросительного и восклицательного знаков сначала ставится вопросительный (как основной, характеризующий предложение по цели высказывания), а затем восклицательный (как знак интонационный).