Предпочтителен предлог по.
Ни один из этих предлогов в данном случае не годится. Корректно: Выражаю благодарность всем, кто неустанно трудится в сфере охраны и защиты лесного комплекса... Выражаю благодарность всем, кто неустанно трудится, охраняя и защищая лесной комплекс...
Запятая перед или не нужна.
Частица вроде не выделяется запятыми.
В обоих случаях запятая нужна: требуется обособление деепричастного оборота.
Запятая не нужна.
С прописной буквы пишутся названия высших государственных должностей и титулов в официальных текстах. Если в деловой переписке цитируются такие тексты, прописная буква сохраняется, например: В соответствии с Указом Президента Российской Федерации... За пределами официальных текстов названия должностей пишутся со строчной буквы (в том числе в деловой переписке).
Здесь требуется тире, которое используется для обособления распространенного инфинитивного определения, стоящего в конце предложения и относящегося к существительному, которое имеет при себе другое определение. См. § 60 в «Правилах русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
С прописной буквы пишется первое слово официального названия: Историко-краеведческий музей АлтГПУ.