Мужскую фамилию Маханёк можно склонять двояким образом: с выпадением гласного (Маханька, Маханьку и т. д.) и с сохранением гласного (Маханёка, Маханёку и т. д.). Решение о типе склонения принимает носитель фамилии, но предпочтителен второй вариант (с сохранением гласного), так как в этом случае из косвенных форм легко вывести начальную форму фамилии. 

Мужскую фамилию Черепок можно склонять двояким образом: с выпадением гласного (Черепка, Черепку и т. д.) и с сохранением гласного (Черепока, Черепоку и т. д.). Решение о типе склонения принимает носитель фамилии, но предпочтителен второй вариант (с сохранением гласного), так как в этом случае из косвенных форм легко вывести начальную форму фамилии. 

О человеке может быть сказано только я не знаю (никого) русского, о языке — я не знаю русский и я не знаю русского (хотя последний вариант носит разговорный оттенок).   

Запятая после в том числе не нужна. 

Возможны варианты в зависимости от значения и интонации: 

Я, как носитель языка, чувствую эту разницу — запятые ставятся, если оборот с как имеет дополнительное значение причинности и выделятся интонационно (= «чувствую разницу, потому что я носитель языка»).

Я как носитель языка чувствую эту разницу — запятые не ставятся, если как имеет значение «в качестве». Ср.: Я как носитель языка чувствую эту разницу, а как лингвист могу ее объяснить. 

В предложении Как связать шапку и почему нужно носить шарф запятая не ставится. 

Да, эти фамилии склоняются (и мужские, и женские). Если фамилия оканчивается на гласную, то ее склоняемость/несклоняемость не зависит от пола носителя. Мужские и женские фамилии ведут себя по-разному только в том случае, когда оканчиваются на согласную.

Предпочтителен глагол мучиться (они мучатся). Глагол мучаться (они мучаются) носит разговорный отттенок. 

В статье, на которую Вы ссылаетесь, этот факт объяснен: "В декабре 1906 года Распутин подает прошение на высочайшее имя об изменении своей фамилии на Распутин-Новых, ссылаясь на то, что многие его односельчане носят ту же фамилию, из-за чего могут быть недоразумения. Прошение было удовлетворено (Варламов А. Н. [tululu.org/read14005/ Григорий Распутин-Новый]. — М.: Молодая гвардия, 2007. — 851 с. — (ЖЗЛ). — ISBN 978-5-235-02956-9). 

Интересующие Вас фамилии имеют украинское происхождение. В украинском языке согласный перед суффиксом -енко произносится как твердый.