Нужно писать слитно. Но лучше перестроить фразу например: в случае, если плата не взимается.
Правильно слитное написание: вы неправильно его поняли.
Точка правомерна.
К сожалению, Вы не привели затруднившую Вас фразу.
Правильно: о не совсем благочинных... Следует отметить, что слово благочинный сопровождается в словарях пометой устар. (устаревшее), в современной официально-деловой речи его употребление вряд ли оправданно.
Первое слово в собственном наименовании документа нужно склонять.
Правильно: в 99,9 случая из 100. Существительным управляет дробная часть: девяти десятых случая.
Это зависит от того, какое учреждение за вывеской. Если там действительно криминальная милиция, то языковых ошибок нет.
Корректно: необходимы документы на право осуществления деятельности, в случае если осуществление деятельности подлежит...
Эти слова нужно выделить как вводные, если они употреблены в значении "по крайней мере".