Употребление слова город (и сокращения г.) перед названием города – характерная черта канцелярской речи, поэтому в «Справочнике издателя и автора» А. Э. Мильчина, Л. К. Чельцовой дана рекомендация употреблять сокращение г. (и полное слово город) ограниченно, преимущественно перед названиями городов, совпадающими с фамилиями людей, напр. г. Пушкин, г. Королев. Однако на практике эта рекомендация редко соблюдается, сокращение г. и полное слово город употребляют перед названиями всех городов.
Здесь корректно: в г. Томске; в томском филиале ООО "Сервис".
Название склоняется: в Миассе, в г. Миассе. О склонении географических названий см. в «Письмовнике».
Корректно: на базе г. Биробиджана.
Правильно: родился в г. Нахичевани-на-Дону.
В слове ага на месте буквы Г произносится звук [г] длительный, образующийся так же, как [х], но с голосом (этот звук также называют фрикативный [г]).