1, 3. См. «Письмовник», раздел «Какой падеж нужен при отрицании?».
2. Оба варианта верны. Слово микроб может употребляться и как одушевленное, и как неодушевленное существительное. Подробнее см. в «Письмовнике», раздел «Изучать микробов или микробы? Одушевленность существительных».
Корректно: навстречу грозной тишине.
Запятую можно поставить или до слова потому, или после него. Выбор зависит от интонации: если на потому падает логическое ударение и после этого слова делается пауза, то запятая ставится на месте этой паузы (между потому и что). Если такой интонации нет, а логическое ударение падает на ушел, то запятая ставится перед потому что.
В использовании кавычек нет необходимости.
Лучше так: ... изменения заметили молодые люди (82 %) и пожилые (79 %).
Корректно: Люди расходятся врозь, нападают поодиночке, вместо того чтобы становиться толпой против толпы.
Знаки расставлены верно.
Знаки препинания расставлены верно.
Корректно: ...не имеющие возможности.