Воспользуйтесь, пожалуйста, ресурсом «Орфографическим словарем».
По правилам французско-русской практической транскрипции g здесь надо передавать как г, ou как у, ill между произносимыми гласными как й, r как р, d в конце слов не передается. Нет единства во взглядах на передачу a после ll, произносимого как [j]: одни справочники предлагают передавать его через а, другие через я. Получаем допустимые варианты Гуйар и Гуйяр.
Оба варианта корректны.
Произносится: нет стёкол. На письме употребление ё необязательно, можно написать нет стекол.
Да, запятую надо поставить.
Мотивировка выражения прозрачна: британский флаг состоит из вертикальных, горизонтальных, диагональных полосок белого, и красного цвета на синем фоне. Порвать на британский флаг (буквально) – порвать на полоски, на лоскутки, на клочки.
Запятая не требуется. Должность и воинское звание – неоднородные приложения.
Корректно: заповедник «Три столба», «Томские стоянки».