Наречное выражение в конечном счете не требует выделения знаками препинания.
Можно так: подписанный сторонами с помощью электронно-цифровой подписи.
Запятая и тире в этом предложении не нужны.
После присоединительного союза (в начале самостоятельного предложения) запятая обычно не ставится, так как союз тесно примыкает к следующему за ним вводному слову. Однако запятая возможна при интонационном выделении вводных слов. Окончательное решение принимает автор текста.
Обычно обороты с производными предлогами в начале предложения не обособляются. Чтобы более точно сказать, нужны запятые или нет, необходимо знать все предложение. Условия обособления описаны в «Справочнике по пунктуации».
Знаки препинания расставлены верно.
Запятую можно поставить.
Пунктуация корректна.
