Да, конечно.
Можно использовать скобки: При осуществлении операций (как облагаемых, так и необлагаемых налогом) организацией допускались ошибки.
Корректно с запятой.
Следует руководствоваться словарем.
С точки зрения авторов толковых словарей варианты равноправны. Однако в справочнике Д. Э. Розенталя «Управление в русском языке») приведена такая рекомендация: с помощью – обычно при указании орудия, средства совершения действия, при помощи – при указании лица.
«Русский орфографический словарь» РАН дает оба сокращения как нормативные.
Оба варианта возможны, первый удачнее.
Тире не требуется.
В суффиксах страдательных причастий настоящего времени и соотносительных с ними прилагательных пишется буква е в образованиях от глаголов I спряжения, буква и – в образованиях от глаголов II спряжения (исключение: движимый от двигать).