Верно: в городе Белгороде, в Республике Таджикистан.
Если говорить только об орфографии и не обращать внимания на стилистическую несогласованность (канцелярское в отсутствие... и разговорное шоколадка в одной фразе; кроме того, в отсутствие обычно указывает на лицо), то возможны оба варианта в зависимости от значения и контекста. Ср.: В отсутствие в кармане пиджака шоколадки приходится закусывать чипсами и В отсутствии в кармане пиджака шоколадки он не видел ничего страшного.
См. «1toponimy/">Азбучные истины».
Корректно: Расскажите о планах развития в России, и в Петербурге в частности, сетей...
В «Письмовнике».
Здесь предлог нужно повторить, потому что существительные стоят в форме разных падежей — предложного и винительного.
1. Верное написание: энкавэдэшный. Это разговорное слово.
2. Пожалуйста, поясните вопрос. Это жаргонное слово, но если есть необходимость использовать именно его - оно должно быть использовано.
3. Мы бы написали все строчными.
Обязательно писать букву Ё в именах собственных. Подробно см. в izhizn/28_618">статье А. В. Суперанской.