Вы правы в том, что кавычки употреблены неудачно. Если их и ставить, то закрыть нужно после фамилии. Однако при употреблении названия не в юридических документах в форме школа № 2129 имени Героя Советского Союза П.И. Романова кавычки не нужны вообще.
Ответ департамента образования тоже верен: нормы употребления кавычек не устанавливаются законодательно. Как записали название в уставе, так и будет оно воспроизводиться во всех документах. Чтобы изменить название, нужно произвести сложные юридические действия, на это нужна добрая воля руководителя организации и его руководства. Изменение даже только кавычек в названии влечет за собой множество юридических проблем, поэтому обычно названия сохраняют в том виде, в котором они уже закреплены.
Мекка – существительное женского рода. Так что ошибки нет.
Это сочетание само по себе не требует обособления.
Правильно: в соответствии с чем-либо (предлог), например: сделать в соответствии с графиком, но: привести что-либо в соответствие чему-либо, с чем-либо.
Правильно: в случае отказа в просьбе.
Анапест.
Принято говорить: доступ в Интернет. Но: получить доступ к секретным документам.
Как правило, слово используется в том падеже, которого требует его синтаксическое окружение.
Ударение в фамилии художника падает на первый слог: Василий Пукирев.
Части предложения нужно разделить запятой: Ни в городе Богдан, ни в селе Селифан.