Правильно: взяты.
Предпочтительнее такая конструкция: награждается Иванов Иван, ученик 5 класса «А» МАОУ СОШ № 40.
По общему правилу имя деда не нуждается в обособлении: существительное дед — нераспространенное приложение, относящееся к имени собственному. Однако если существительное дед логически выделить и, как следствие, придать имени собственному характер попутного замечания, приложением станет уже имя собственное; такое приложение нужно обособить. (См. об этом параграф 63 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.) Таким образом, оба варианта расстановки знаков препинания корректны, но между ними есть смысловое различие.
Тире ставится, поскольку подлежащее и сказуемое выражены существительными.
Правильно: мироточат.
Верно слитное написание: притом Иван полностью уверен...
Запятая после директор не нужна.
Всякой твари по паре (разг. шутл.) - всех понемногу.