Оснований для постановки запятых нет.
В связи с (чем-либо) – предлог.
Начальная форма - удаться. Форма 3-го лица - удастся.
Выделять слово фактически не нужно.
Слова "весьма далеким от политических" нужно обособить (это определительный оборот, расположенный после определяемого слова).
Запятая не нужна: После болезни стал более ворчливым, причем без причины.
Возможны оба варианта написания. При раздельном подразумевается противопоставление. Окончательное решение принимает автор текста (в данном случае, видимо, Л. Н. Толстой).
Вы написали верно. При употреблении отрицания расчленение сложного союза обязательно: И не потому, что еще молод, а по другой причине.
Принимается во внимание хронология возможных событий: как только остановишься, так немедленно происходят описываемые болотные процессы.
Во второй части предложения (после но) подлежащее и сказуемое выражены существительными. Однако тире между ними не ставится, поскольку перед сказуемым есть частица вовсе и отрицание. Таким образом, верная пунктуация: Они действительно обладают отличной выносливостью, но причина этого вовсе не врожденная способность.