Спасибо, сообщим составителям словаря и поправим.
Официальное название страны в именительном падеже – Королевство Нидерландов. Правильно: в Королевстве Нидерландов.
Дефисное написание правильно. Ученый здесь – существительное в значении 'высококвалифицированный специалист в области науки'. При раздельном написании ученый превратится в прилагательное со значением 'грамотный, образованный', т. е. сочетание ученый пчеловод будет означать 'грамотный пчеловод' (подразумевается, что есть и пчеловоды-неучи).
Сочетание хранить с доходностью некорректно.
Нет, запятую здесь ставить не надо: оборот с как образует именную часть сказуемого.
На месте скобок не нужно ставить знак препинания.
Предложенный Вами вариант пунктуации корректен.
Нет, эти слова не являются вводными и не обособляются.
