Правильно: врио.
В данном случае запятая не нужна.
Это слова среднего рода. Род аббревиатур определяется по опорному слову в словосочетании. В данном случае это слова агентство и министерство.
По той же причине, что и в Италии Москву называют Mosca: любые заимствованные слова, в особенности собственные имена, претерпевают изменения, осваиваются в "новом" для себя языке. Исторические преобразования слова Рим описаны в этимологическом словаре Макса Фасмера. Приводим словарную статью:
index" id="selectionindex5">Этимологический словарь русского языка. — М.: Прогресс. М. Р. Фасмер. 1964—1973.
Такое написание соответствует правилу: пишутся с двумя н причастия и прилагательные на -ованный, -ёванный, -еванный (образованные от глаголов на -овать, -евать).
Верно: врио.
Точку ставят после второго предложения в скобках.