Знаки препинания стоят верно.
В начале сложноподчиненного предложения не разделяются запятой сочинительный и подчинительный союзы. Верно: И когда показалась впереди деревня, он и вовсе развеселел.
Запятые стоят правильно.
Микроорганизм — неодушевленное существительное, поэтмоу верно: устранять вредоносные микроорганизмы.
Запятая перед и сказал не нужна.
Книжный (официально-деловой) вариант: осуществлять мониторинг. В разговорной речи возможно: мониторить.
Правильно: стоять на раздорожье.
Верно, если имеется в виду 'в качестве стартовой площадки'.
Запятая нужна: Мы включаем свет, только когда темно. Если перед подчинительным союзом стоят усилительные частицы как раз, только, лишь, исключительно и т. п., то запятая перед ними ставится вопреки интонации.
