церковь, -кви, тв. -ковью, мн. -кви, церквей, -квам и -квям (религиозная организация; храм) и Церковь, -кви, тв. -ковью (Божественное учреждение, богосл.; вместо Русская православная церковь); Белая Церковь (город)
ручей, ручья; но (в названиях населенных пунктов) Ручей, Ручья, напр: Белый Ручей, Бочаров Ручей (поселки)