Правильно: приложение геймифицировано. Краткие формы страдательных причастий прошедшего времени пишутся с одним н.

Запятая в позиции (2) не нужна. Между союзом и, в данном случае соединяющим части сложносочиненного предложения, и словом поэтому, с которого начинается вторая часть, нет оснований ставить запятую. Слово поэтому в словарях имеет разную грамматическую квалификацию, но ни в одном источнике не характеризуется как вводное слово.

Верно: контактносубординированный, структурносубординированный

Сложные прилагательные, образованные из основ слов, отношение между которыми носит подчинительный характер, пишутся слитно ("железнодорожный" - от "железная дорога", "контрактносубординированный" - от "контрактная субординация").

См. §130 Правил русской орфографии и пунктуации (Полный академический справочник под ред. В. В. Лопатина).