пе́пси, нескл., ж.
ПЕ́ПСИ \\ [п’]е́пси; пе́[п]си.
ПЕ́ПСИ, нескл., ж. Напиток в виде жидкости темно-коричневого цвета, получаемый в результате смешивания воды и различных химических компонентов и насыщения этой смеси газом, употребляемый обычно в охлажденном виде для утоления жажды и/или получения вкусового удовольствия, а также для повышения жизненной активности; син. пепси-кола. В Екатеринбурге построен завод компании «Пепси-кола» для производства пепси.
Ответы справочной службы
Знаки препинания лучше расставить так: Люди часто сравнивают Колу и Пепси (ведь их вкус очень похож) и ломают голову: что выбрать?
Согласно академическому «Русскому орфографическому словарю», пепси — тоже существительное женского рода. Но можно понять, почему в речи возникает согласование по мужскому роду. Влияет внешний фонетический облик: пепси похоже на те несклоняемые существительные, которые под влиянием родового слова напиток могут согласовываться по мужскому роду.
Корректно без кавычек.