Пропущена не орфограмма, а буква. В слове фле́ксить корневой гласный находится под ударением, поэтому там нет никакой орфограммы.

Нет, в приставках "пре-" и "при-" не чередующиеся гласные. Эти приставки имеют разные значения.   

Безударная проверяемая гласная: клони́ровать — клон.

Ответы на подобные вопросы можно найти в информационно-поисковой системе «Орфографическое комментирование русского словаря».

Да, это орфограмма.

Пожалуйста, воспользуйтесь словарями.

Это вставная конструкция. Она может выделяться скобками или тире с обеих сторон, выбор за автором.

Вставные конструкции (слова, сочетания слов, предложения) выделяются скобками или тире. Они содержат дополнительные сведения, замечания, уточнения, пояснения, поправки к сказанному; разъясняют, толкуют основную часть высказывания. В тексте вставной конструкции сохраняются все необходимые для нее знаки (запятая, восклицательный и вопросительный знаки, многоточие, двоеточие). Например: Валерия — так звали девушку, от тоски по которой я сбежал из деревни в Москву, — слушала меня, мечтательно глядела перед собой.

Орфограммой называют букву или сочетание букв в слове, которые проверяются орфографическим правилом или требуют запоминания в словарном порядке.

Обессилившие – от обессилить (кого, что). Обессилевшие – от обессилеть (стать бессильным).

Вы правы. Женские имена на -ия, в которых я безударное, имеют в дательном падеже окончание И: Марии, Лилии, Виктории. Однако личные имена восточного и иного происхождения, оканчивающиеся на ударное я, имеют в дательном падеже окончание Е: Зульфия – Зульфие, Алия – Алие. Это правило изложено в полном академическом справочнике «Правила русской орфографии и пунктуации» (М., 2006), «Словаре русских личных имен» А. В. Суперанской (М., 2004) и мн. др. источниках.