ВЫУЧИВАТЬ и УЧИТЬ, несов. (сов. выучить), что. Постигать (постичь) что-л., много раз повторяя, запоминая что-л., поняв что-л. как следует, разобравшись в чем-л., хорошо усвоить; cин. готовить, делать, заучивать [impf. to learn]. Ребенок учил уроки под наблюдением родителей. Дети хорошо выучили стихотворение и заслужили похвалу педагога.
Ответы справочной службы
Вероятно, это связано с тем, что словарные слова чаще всего проверяются не по правилу, а по словарю, их нельзя подвести под правило (или сделать это по каким-то причинам очень трудно), их нужно выучивать в ряду других, особо трудных слов в «словарном порядке».