Да, нужны: Атомная подводная лодка "К-3" — экспонат музея.
1. Ответ на вопрос «Какой завод использует труд более эффективно?» не столь очевиден. 2. Кавычки нужны.
Юный пионер - не ошибка.
Требуется тире: Среди экспонатов — парашют корабля. Однако при отсутствии паузы и логического ударения на обстоятельственном члене предложения тире не ставится.