Предпочтительный вариант: шевелЯтся, допустимый – шевЕлятся.
Правильно раздельное написание: не шевелясь. Не с деепричастиями пишется раздельно.
Следует либо поставить точку с запятой, либо разделить предложение на два: Она просачивалась через трещины; как только мальчик шевелился, она исчезала или Она просачивалась через трещины. Как только мальчик шевелился, она исчезала.