Фамилия Хорунжий склоняется по модели прилагательного: Хорунжий, Хорунжего, Хорунжему и т. д.
Корректно: рабочие, лесничие, хорунжие. Эти существительные склоняются по т. н. адъективному склонению (по образцу прилагательных: синие, красные, желтые).
Фамилия склоняется по образцу прилагательного: Хорунжего, Хорунжему и т. д.
Фамилию Хорунжий следует склонять как нарицательное существительное хорунжий: Хорунжего, Хорунжему и т. д.