Верно: меняет флагман (в вин. п.). Но, поскольку форму винительного падежа можно перепутать с формой именительного падежа в данном контексте, лучше переформулировать: у BMW новый флагман.
См. ответ 290554.
Это приложения, которым, кстати, как раз и свойственна уточняющая функция.