Эти слова пишутся строчными буквами, кавычки не требуются.
Предпочтителен второй вариант.
Слова ученый совет пишутся строчными.
Верно: учебный план МОУ "Орлинская СОШ".
Написание зависит от смысла: кабачок тушёный с помидорами = тушёный кабачок плюс помидоры (помидоры не имеют отношения к процессу тушения); кабачок, тушенный с помидорами = кабачок, который тушили вместе с помидорами.
Корректно: русский ученый (как о выходцах из России, так и о россиянах, а также о русских) и российский ученый (гражданин России).
Корректно: учебный центр "Интерколор".
Возможный вариант: Учебный план профессиональной подготовки.