Правильно слитное написание: моторвагонный подвижной состав.
В официальных бумагах: Президент России. Неофициально: президент России, российский президент.
Верно написание с двумя с.
Со строчной. Заглавная и прописная - это одно и то же.
Сегодня (с 1956 года по крайней мере) аббревиатуры пишут без точек.