Правильно: в Самаре.
См. в Горячей десятке вопросов.
Название при словах городской округ обычно не склоняется. Верно: в г. о. Самара.
В конструкциях с составными числительными, оканчивающимися на два, три, четыре, винительный падеж сохраняет форму именительного независимо от категории одушевленности. Литературная норма: трудоустроили семьдесят три беженца. Вариант трудоустроили семьдесят трех беженцев – разговорный.
Правильно: в городе Самаре.
См. ответ на вопрос № 281295.