Выбор предлога зависит от контекста, например: поехать в НПО, жалоба на НПО.
По-русски правильно: Таллин.
Дополнительные знаки препинания не требуются: Таллин так Таллин.
Правильно с прописной буквы.
Предпочтительно не склонять аббревиатуру: соответствует СанПиН.
Правильно: Таллин.