Правилен первый вариант.
Вы написали это сочетание правильно: не с руки.
Оба варианта верны. Выбор делает автор текста.
В предложении Руки как ветви сравнительный оборот является сказуемым, а потому не обособляется. См. параграф 90 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.