Оба варианта возможны.
Здесь верно: ...участков.
Предложение не вполне корректно. Верно: лицо владеет более чем 50 % паев (владеет более чем пятьюдесятью процентами паев); при владении не более чем 25 % (при владении не более чем двадцатью пятью процентами).
В этом случае лучше развернуть графическое сокращение до полного слова.