Да, в этом слове корень с чередованием.
Все названные варианты возможны.
Следует перестроить предложение, например: В инструкциях должны приводиться указания, аналогичные приведенным в п. 9 Стандарта, и должна применяться соответствующая последовательность изложения раздела.