Верно: Прибрежные мегаполисы и некоторые населенные острова, например Мальдивы, будут затоплены.
Неправильно.
Название Агиос-Николаос (точнее, Айос-Николаос) желательно склонять: в Айос-Николаосе, из Айос-Николаоса.
Теперь нам тоже придется мучиться.
Запятая перед союзом и не ставится, если части сложносочиненного предложения имеют общий второстепенный член ("в кладовке").