Если договор подписал генеральный директор, то верно: договор, подписанный генеральным директором.
Запятая не нужна.
Можно так: подписанный сторонами с помощью электронно-цифровой подписи.
Верно: Аемшей (Аемшой) Геннадием.
Варианты различаются по смыслу. Видимо, правильнее: экземпляр, подписанный (обратите внимание, что нужно поставить запятую).
Нужно поставить одну запятую.
Запятая не ставится.
Кавычки не нужны.
Запятая не нужна. Перед неповторяющимися разделительными союзами или, либо между однородными членами предложения запятая не ставится.