Запятая нужна. Союз как присоединяет придаточное предложение, в данном случае неполное: Перейдите в следующий раздел и пройдите стандартные этапы, как [их проходят] в обычном браузере.
Запятая перед вторым союзом или, закрывающая придаточную часть чтобы начать все сначала, нужна.
Если эта часть относится только к сказуемому перейдите и не относится к сказуемому воспользуйтесь, то запятая нужна и перед первым или. В этом случае предложение можно перестроить так: Воспользуйтесь меню, или, чтобы начать все сначала, перейдите на главную, или просто расслабьтесь и выпейте чайку.
Союз после того как обычно не расчленяется, если придаточная часть стоит перед главной: После того как ваш ПК перезагрузится... Но и постановка запятой ошибкой не будет.
Пунктуация верна.