Предлог "для" здесь будет вполне уместен.
Возможны такие варианты.
Данные обрабатываются с применением современного программного обеспечения, после чего по результатам проведенных исследований формируется отчет.
Данные обрабатываются с применением современного программного обеспечения. После этого по результатам проведенных исследований формируется отчет.