Корректно: доход не превышает прожиточного минимума.
Количество выходных дней не превышает двух.
Да, запятая перед причастным оборотом, стоящим после определяемого слова, нужна: Содержание в продукции вредных для здоровья веществ не превышает допустимого уровня, установленного ТР ТС 021/211 «О безопасности пищевой продукции.
Которой — это местоимение, в данном случае оно играет роль союзного слова.
В целом предложение сложноподчиненное. Главная часть: Закупка... услуги. Придаточная: Стоимость... которой... не превышает... Между этими частями ставится запятая. Вторая запятая (после слов финансового года) не требуется.
Верная пунктуация: При этом обратим внимание на то, что, если покупателю в установленные сроки необходимо приобретение определенного вида товаров и если цена договора на поставку товара не превышает 100 тыс. руб., у поставщика указанных товаров есть возможность...
Пробелы нужны, такое написание зафиксировано в "Русском орфографическом словаре" РАН. Пробелы ставятся между сокращенными словами.
Лучше: стоимость которого не превышает...