Правильно: котельная (не котельня). Форма именительного падежа мн. числа: котельные, форма предложного падежа: в котельных.
ТЭЦ — это более крупный объект с более широкими функциями. Мы не рекомендуем использовать слова ТЭЦ и котельная как синонимы.
Правильно: Специалисты Люберецкой теплосети выполнили замену оборудования химводоочистки в котельной на ул. Космонавтов.
Пунктуация корректна.
Правильно: отдельно стоящая.
Лучше: металлические емкости для сжатого или сжиженного газа; передвижные котельные установки (в этом сочетании определение "передвижные" характеризует не одно слово, а словосочетание "котельные установки"; определение, относящееся к словосочетанию, располагается перед данным словосочетанием, не разрывая его).