См. вопрос 282667. Это особенность употребления именно слова сторона. Так, в сочетании на все четыре стороны ударение тоже падает "нелогично" с точки зрения современного языка.

Правильно: молоть кофе.

Верно: молоть кофе - мелю кофе.

При существительных мужского и среднего рода, зависящих от числительных два, три, четыре, определение, находящееся между числительным и существительным, принимает форму родительного падежа множественного числа: два горячих кофе.

Как и раньше: горячий кофе – предпочтительный вариант, отвечающий строгой литературной норме, горячее кофе – вариант, допустимый в непринужденной разговорной речи.

Не ищите во всем логику. Сложившаяся литературная норма: молоть, но мелю, мелет, мелют.

Верно: мелю (размалываю) кофе.

Фиксация: «Копи Лювак» (Kopi Luwak).

Существительное КОФЕ в русском языке мужского рода. В разговорной речи допускается согласование по среднему роду.