Лучше первый вариант. Со вторым тире становится неясен смысл предложения.
Правильно: работать интенсивнее или работать более интенсивно (но не более интенсивнее).
Об этой орфографической проблеме можно прочитать в информационно-поисковой системе Орфографическое комментирование русского словаря.