Трудно судить без достаточного контекста. Скорее всего, здесь верно: в соответствии.
Кавычки не требуются.
Знаки препинания не требуются.
1, 3. См. «Письмовник», раздел «Какой падеж нужен при отрицании?».
2. Оба варианта верны. Слово микроб может употребляться и как одушевленное, и как неодушевленное существительное. Подробнее см. в «Письмовнике», раздел «Изучать микробов или микробы? Одушевленность существительных».
Это слово может быть существительным общего рода.
Существуют оба слова - дожигание и дожиг. Об употребительности того или иного термина нужно спросить у специалистов.
Да, запятая перед причастным оборотом, стоящим после определяемого слова, нужна: Содержание в продукции вредных для здоровья веществ не превышает допустимого уровня, установленного ТР ТС 021/211 «О безопасности пищевой продукции.