Правильно: По нашим оценкам, это займет более двух месяцев.
Предпочтителен второй вариант.
Оба варианта корректны.
Корректно слитное написание при отсутствии противопоставления.
Оба варианта возможны.
В первом сочетании запятая не нужна. Во втором – запятая также не ставится, если оборот используется в значении 'никто не знает'.