Запятая нужна. Запятая ставится перед деепричастным оборотом и в том случае, когда в начале его стоят частицы только, лишь.
Да, но Европейский союз не является и государством! Союз пишется с прописной в официальных названиях государств: Союз Советских Социалистических Республик, Австралийский Союз.
Тире: страны - члены Евросоюза.
Возможно:
Текст иска опубликован в «Официальном журнале Евросоюза».
Текст иска опубликован в официальном журнале Евросоюза.