Да, здесь правильно раздельное написание не досыпает.
Не с глаголом пишется раздельно. Однако слитно пишется глагол недосыпает в значениях «не высыпается» и «насыпает меньше нужного или возможного». Не здесь – часть приставки недо...
Оба варианта корректны.
Глагол насыпать со словом суп (в традиционном значении этого слова) не сочетается; суп можно только налить. Сочетание насыпать суп теоретически возможно, если речь идет о сухой смеси, которую необходимо залить кипятком (так называемые быстрые супы).